中盐运城盐化集团有限公司的组织架构详尽，其内部设有多个核心部门。首先是总部机构，其中包括办公室，负责日常管理和协调工作；人力资源部，负责员工的招聘、培训和福利管理；财务处，负责集团的财务规划和审计工作。同时，集团设有专门的党务机构，如党委工作部和纪委监察处，确保党的指导和监督工作有序进行；群众工作部致力于员工关系和社区联络；盐湖管理处和离退休管理处则关注盐湖资源的管理和退休员工的关怀。
在业务运营层面，集团设有公用事业部，负责集团公用设施和项目的运营；运输部则专注于物流和运输管理。此外，集团还拥有多家成员企业，如南风化工集团股份有限公司，专注于化工产品的生产；山西省运城盐化机械制造有限公司，专长于机械制造；运城市南风宾馆有限公司，提供优质的住宿服务；而天津市南风贸易有限公司则负责集团的贸易业务，拓展市场和渠道。
山西焦煤运城盐化集团有限责任公司前身为山西运城盐化局，2009年2月经中国盐业总公司重组后更名为中盐运城盐化集团有限公司，2012年12月经山西焦煤集团重组后更为现在名称，为山西焦煤集团有限公司的子公司，煤矿子公司正职级建制，并由其控股经营南风化工集团股份有限公司。注册资本50800万元，总资产45亿元，主要经营无机盐系列产品、日用化工系列产品、国际贸易、化工机械加工、医药、旅游业及服务业等，是全国最大的无机盐生产基地和全国最大的日用洗涤剂生产企业之一。