在电泳实验中，薄膜的点样端应该放置在电泳槽的负极位置。这是基于电泳的基本原理，即泳动方向是从负极向正极的。无论是DNA电泳还是蛋白质SDS-PAGE电泳，样本通常带负电荷，因此为了确保样本能够向正极移动，点样孔和点样端均需置于负极区域，以便于样品在电场作用下进行有效的泳动。
对于醋酸纤维素薄膜电泳，由于薄膜具有两面性，点样面粗糙且导电，而反面光滑不导电。为了形成电流通道，让蛋白质进行电回泳，需要将点样面朝下并搭在盐桥上。在此过程中，必须确保点样线不接触到盐桥上的纱布，以免样品被纱布吸附，影响实验结果。
综上所述，点样端放置在电泳槽的负极，这是为了顺应电泳的移动方向，确保样品的正确泳动和实验的顺利进行。同时，操作时需要特别注意薄膜的正确使用方式，以避免不必要的样本损失。