《生化危机》编年史：第五期——黑暗阴谋的揭露与反击
在2003年的高加索事件中，保护伞的防线被严重动摇，"塔洛斯计划"被迫转移至一座废弃化工厂，成为了恐怖组织的秘密武器库。这个设施受到“猩红女王”系统的严密守护，令多方试图摧毁的行动受阻。
俄罗斯政府的反击行动
为了应对这一威胁，政府决定秘密行动，成立了反生化部队，传奇人物克里斯·雷德菲尔德和吉尔·瓦伦蒂安联手出击。威斯克利用内应埃尔罗伊的背叛，试图破坏设施，却在此过程中暴露了自己并感染了病毒。
塔洛斯事件：正义的揭露与终结
克里斯和吉尔在与塔洛斯的斗争中，揭露了保护伞的罪行，威斯克趁乱下载关键证据，最终导致保护伞的覆灭。然而，他的野心并未止步于此……
狼之谷风云：新威胁的崛起
威斯克的目光转向了狼之谷，一个新目标的出现预示着他的势力将有所扩张。同时，15世纪光明教的后裔萨德勒，意图通过普拉卡基因重振教派，将“注入”变为强制信仰的手段。
拉蒙·萨拉查：被误导的棋子
萨德勒巧妙利用了拉蒙·萨拉查，一个被蒙蔽的人，释放了普拉卡的力量，导致加纳多斯村民陷入狂热，对外来者展开了极端行动。塞拉博士受雇于萨德勒，但任务背后隐藏着个人动机，一封邮件意外落入了艾达王的视线，引发了一场交换样本的角力。
克劳泽与威斯克：交织的命运
克劳泽被威斯克利用，打入光明会内部，但并未完全获得信任。神秘公司对威斯克的忠诚产生了怀疑，而威斯克暗中策划着更大的阴谋。斯克和威斯克的关系错综复杂，威斯克与制药公司联合会成员特里塞尔的联系，使剧情走向更加扑朔迷离。
光明教的野心导致总统之女阿什莉·格拉汉姆的绑架，里昂在狼之谷面临生死考验。艾达的钟声救了里昂，并在危急关头救下了塞拉，然而，他们的任务屡遭阻碍，艾什莉再次落入魔掌。在寻找抑制剂和样本的过程中，塞拉的命运在原版与重制版中展现了不同走向。
威斯克的狠手让艾达执行炸岛计划，她虽照办，却为里昂设下后手。在拯救艾什莉和对抗寄生虫的战斗中，萨德勒的计划接近尾声。艾达被擒，里昂奋力救援，拿到关键的火箭弹。艾达带走普拉卡样本，尽管里昂心存疑惑，但仍选择了让她离开。在飞机上，艾达得知威斯克的险恶用心，决定站出来对抗，阻止他的邪恶计划，控制人类的噩梦似乎才刚刚开始。