孔令东教授还致力于中药炮制、中药制剂和中药指纹图谱研究。参与《中国药典》增补和修订中药饮片藤黄、姜和中药炭药炮制研究。在中药复方人参注射液(升压灵)研究中,提出有效成分与生物学结合评价制剂质量新见解,建立体内药物动力学研究方法。 探索多技术、多方法、多信息、多参数指纹图谱综合分析非线形质量控制模式和评价体系新思路。其课题组首次用IR法、粉末X-射线衍射法、NMR法、LC-DAD-MSD法对该注射液的原料药材、中间体和制剂系统地进行指纹图谱研究,建立了相关分析系统和质量标准,该方法明显优于目前广泛采用的单一技术指纹图谱,具有一定的创新性和先进性。
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