大药房需要交税，要先清固定资产，是在计算应纳税所得额时，企业按照规定计算的固定资产折旧，准予扣除，通过对大药房的固定资产进行清点，及时将可以折旧扣除的固定资产进行造册列明，以便申请扣除免税。
根据《中华人民共和国企业所得税法》第十一条 规定，在计算应纳税所得额时，企业按照规定计算的固定资产折旧，准予扣除。 下列固定资产不得计算折旧扣除： （一）房屋、建筑物以外未投入使用的固定资产； （二）以经营租赁方式租入的固定资产；（三）以融资租赁方式租出的固定资产；（四）已足额提取折旧仍继续使用的固定资产； （五）与经营活动无关的固定资产；（六）单独估价作为固定资产入账的土地；（七）其他不得计算折旧扣除的固定资产。
《企业所得税法实施条例》（中华人民共和国国务院令第512号）第六十条规定：“除国务院财政、税务主管部门另有规定外，固定资产计算折旧的最低年限如下：（1）房屋、建筑物，为20年；（2）飞机、火车、轮船、机器、机械和其他生产设备，为10年；（3）与生产经营活动有关的器具、工具、家具等，为5年；（4）飞机、火车、轮船以外的运输工具，为4年；（5）电子设备，为3年。”
在计算企业所得税时，营收利润要减去固定资产折旧之后再乘以相应税率来计算税额，其中企业部分固定资产都考虑折旧，那么交的税会相应减少。这样也为企业减负。
企业根据自制原始凭证即可入账扣除，一般反映在当期损益类科目里边的，如“管理、销售费用”，也有些折旧反映在“制造费用”里，随着产品的费用分配完工销售，以“主营业务成本”扣除。 税法也规定了一些优惠类的加速折旧，一般只要符合规定而提取的折旧都可以在税前扣除的。
《中华人民共和国企业所得税法》由中华人民共和国第十届全国人民代表大会第五次会议于2007年3月16日通过。最新是2017年2月24日第十二届全国人民代表大会常务委员会第二十六次会议《关于修改<中华人民共和国企业所得税法>的决定》修正。