根据上述职责，市教育局设10个内设机构。
（一）办公室（挂政务信息化办公室牌子）
协助局领导处理机关日常政务；负责机关财务；负责重要会议和重大活动的组织安排；负责督办查办和目标管理工作；负责办理人大议案和政协提案工作；负责机关文秘、保密、信息、宣传、信访、档案、计划生育等工作；负责协调机关安全保卫和综合治理工作及精神文明创建工作；承担局机关及直属单位的政务信息化方面的职责，开展本单位门户网站的建设、运行管理和内容保障工作；承担局机关政务信息公开的日常工作，监督检查政务信息使用、利用和实时更新情况；利用网络平台，推进办公现代化，2010年年底前实现无纸化办公。
（二）人事科
负责机关及局直属单位的干部、人事、工资、人才、机构编制管理和人事档案工作；负责教育系统表彰奖励；组织实施教师资格认定和教师专业技术职务评审；规划并指导全市教育行政干部和中小学校长（含幼儿园园长）队伍建设，抓好“名校长工程”；指导全市各级各类学校内部人事与分配制度改革；具体承担全市师范类大中专毕业生资格审查、档案转递、报到、登记和就业指导工作。
（三）发展规划科
负责全市教育改革与发展战略和研究，并就重大问题进行政策调研；规划并起草贯彻实施教育法规的文件草案；拟订全市教育事业发展的中长期规划；负责中、初等教育布局、结构调整；会同有关部门承办中等教育学校的设置、撤销和更名；制定全市中等及其以下教育招生计划，负责教育事业统计并收集、整理相关资料；管理市本级基本建设项目及教育基建投资；具体负责涉外项目建设等方面工作。
（四）财务科
负责全市教育经费的筹措、管理、监测，督促教育经费“三个增长”的贯彻落实；负责教育经费的预算、决算、分配和使用；管理教育专项经费；协助做好教育基金的筹集和“三税”教育附加费的征收、管理；管理教育系统国有资产；负责全市教育系统预算内、外各项资金的审计工作；指导和推进学校总务后勤工作的改革。
（五）义务教育科
综合管理全市义务教育工作；拟订并贯彻推进义务教育均衡发展的政策，提出保障学生接受义务教育的政策措施；规范义务教育学校办学行为，推进教学改革和课程改革；组织审定义务教育阶段市级课程教科书，指导教学信息、图书馆、实验室设备配备；指导义务教育教学改革；管理义务教育阶段学校的德育、校外教育和安全管理；负责全市义务教育学校“名校工程”的规划、实施和管理工作；协调有关职能部门对社会力量办学机构举办的义务教育学校的评估与管理工作。
（六）非义务教育科
综合管理全市高中教育、幼儿教育和特殊教育工作；组织审定高中教育、幼儿教育和特殊教育市级课程教科书，指导教学信息、图书馆、实验室设备配备；指导高中教育、幼儿教育和特殊教育的教学改革；管理高中教育、幼儿教育和特殊教育学校的德育、校外教育和安全管理；负责全市高中教育学校“名校工程”的规划、实施和管理工作；负责普通高中招生会考和学籍管理、毕业生审批及颁证工作；协调有关职能部门对社会力量办学机构举办的非义务教育阶段学校的评估与管理工作。
（七）职业教育与成人教育科
统筹管理全市普通及成人中等职业学历教育、成人文化技术教育；指导中等职业教育教学改革和德育工作；负责中等职业教育教材建设和师资培训；负责中等职业教育和成人教育招生、学籍管理、毕业生审批及颁证工作；指导全市农村教育综合改革工作；承担扫除青壮年文盲的管理与指导工作；协调有关职能部门对社会力量办学机构举办的各类中等职业学校的评估与管理工作。
（八）师资培训科
综合管理全市中小学教师的培养与培训；负责教师进修学校的教育教学管理、学籍管理、毕业生审批及颁证工作；负责全市教师学历培训和继续教育工作；负责全市中小学“名师工程”的规划、实施和管理工作；负责指导全市教师职业道德建设。
（九）体育卫生艺术教育科
负责全市学校体育、卫生健康教育、艺术教育工作；拟订体育、卫生、艺术教育教学的指导性文件。协调学校组团参加重大体育竞赛和艺术活动；指导全市学生的军训、国防教育和安全教育工作。
（十）法制教育安全科
负责全市教育改革与发展战略的研究和重大问题的政策调研；负责教育系统综合法规宣传教育和执法监督工作；承担机关有关规范性文件的审核工作；负责机关的行政复议和对外应诉工作；负责全市教育安全的综合协调工作。
离退休干部工作科。负责局机关离退休干部服务管理工作；指导所属单位的离退休干部工作；承担市教育系统关心下一代委员会日常工作。
机关党组织和纪检（监察）机构按有关规定设置。
