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有两组数据,每组三个重复,去做加权基因共表达,这个结果可以使用吗?结果能得到认可吗?请大家指教
如题所述
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数据
的
基因共表达
网络分析
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结果
中每个
基因做
表达量分析,计算每个基因的表达量FPKM,如果基因的表达量,也就是FPKM值<0.5,认为基因无
表达,
去除这部分基因。然后,统计每个时期不同品种
基因表达
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组间差异检验,终于有人讲清楚了!
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结果
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,做重复
压根没有难度,就是从生物学、统计学角度考虑,也需要做重复。 如果是两组样本(...
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三个
生物学
重复
degseq 差异
基因表达
量 倍数关系
答:
由此可知,设计的实验如果没有生物学
重复,
或者生物学重复的数量不够,就不
能得到
有统计意义的实验
结果
;获得的差异表达的
基因
很可能仅仅是少数个体差异的表现,并不能反映疾病或者某种特定生理状态的群体本质特征。3.生物学重复...
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答:
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进行聚类分析,所得到的聚类数未必一致。 2、因子分析(Factor Analysis) 因子分析是指研究从变量群中提取共性因子的统计技术。因子分析就是从大量的数据中...
为何WGCNA分析不建议
使用
筛选好的差异
基因做
分析?
答:
对于RNA-seq
数据,
WGCNA是适用的,但转录
组数据
的分析需经过标准化处理。这是因为不同
基因
的表达量可能受到多种因素影响,标准化可以消除这些干扰,确保分析
结果
的准确性。WGCNA的核心理念在于构建无尺度网络
,这个
网络由表达矩阵...
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