有很大区别，用spss做方差分析，显著水平设定成0.05或0.01的区别在于是否拒绝原假设的判定强弱不同。
1、主要是可能性上有很大区别。
显著性水平取0.01，是在原假设事实正确的情况下，研究者接受这一假设的可能性为99%。
显著性水平取0.05，研究者接受事实正确的原假设的可能性为95%。
扩展资料：
显著水平的意义：
显著性水平是假设检验中的一个概念，是指当原假设为正确时人们却把它拒绝了的概率或风险。它是公认的小概率事件的概率值，必须在每一次统计检验之前确定，通常取α=0.05或α=0.01。这表明，当作出接受原假设的决定时，其正确的可能性（概率）为95%或99%。
在统计学中，差异显著性检验是“统计假设检验”（Statisticalhypothesistesting）的一种，用于检测科学实验中实验组与对照组之间是否有差异以及差异是否显著的办法。
在实验进行过程中，尽管尽量排除随机误差的影响，以突出实验的处理效果，但由于个体间无法避免的差异，以及诸多无法控制的因素，使得实验结果最后表现的观察值处理处理效应之外，还包括实验误差的效应。
因此对两个样本进行比较时，必须判断样本间差异主要是随机误差造成的，还是本质不同或处理效应引起的。
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