1.药品基本目录，可能是指基本药物目录，是医疗机构用药最基础的目录，2009年颁布的目录包含205个西药品规，102个中药品规。
2.药品医保目录，是人力资源和社会保障部颁布的国家基本医疗保险、工伤保险和生育保险药品目录。是各种医疗保险报销药品的依据。基本药物目录的药品全部包含在医保目录里。
3.药品中标目录，是各省开展医疗机构药品集中采购后，中标的产品形成的目录。这些药品既包括基本药物也包括医保目录和非医保目录。
4.新农合药品目录，是各省市实施新型农村合作医疗，使用的药品目录，不同地区可能制定不同的目录，报销比例也可以不同。