非靶向 | 靶向代谢组学数据分析总结-纲要

如题所述

第1个回答  2022-06-01

@(Dayueban)[靶向|非靶向|代谢组学数据分析]

那么在学习数据分析之前,我还是想和大家一起回顾一下什么叫 代谢组学(Metabolomics) 和 代谢组(Metabolome) 。

在中心法则的指导下,基因组、转录组、蛋白组通常以 信息流 的方式呈现,而代谢组被认为是新陈代谢的结果。但是,很多研究表明代谢物可以参与到生命有机体的生理学功能和稳态,比如:

1. 校正批次

1. 数据标准化

2. 数据分析

2.1 多元统计分析

那么PCA分析可以由很多方法实现,包括桌面版的软件 SIMCA-P ,在线分析软件 Metaboanalyst ,以及R语言软件包(stats包里的prcomp()和princomp()函数,FactoMineR包的PCA()函数,ade4包的dudi.pca()函数,以及ExPosition包的epPCA()函数)

2.2 单变量统计分析

2.3 构建回归方程进行预测

2.4 网络分析

[1] Advances in computational metabolomics and databases deepen the understanding of metabolisms

相似回答