三水区地处亚热带，属南亚热带海洋性季风气候，降雨充沛，但分布不均匀，时有洪涝、干旱等灾害发生，夏秋两季常受热带风暴（台风）影响，雷电灾害频繁，属雷暴盛发区。影响三水区的气象灾害主要有：早春的低温阴雨、夏季的台风、暴雨及强对流天气（强雷暴、大风、冰雹等）；冬季的寒潮等。
气温：年平均气温为21.9℃。1月份为全年最冷月，7月份气温最高。年极端最高气温39.1℃（03.7.15）；年极端最低气温零下0.7℃ （57.2.11） 。
降水：年平均降水日数（≥0.1）154.3天。年平均降水量1682.8毫米（4-9月：占总雨量80%）。全年雨季分为两段：4—6月为前汛期，主要是锋面低槽带来的降水；7—9月为后汛期，主要是热带气旋、热带辐合带等引起的降水。
日照：全年日照总时数1721.7小时。一年中最长的日照时数是7月为218.7小时，最短是3月为65.5小时。
雷暴：三水是雷暴多发区，历年平均雷暴日数为81天。 树木 主要有：木棉、榕、樟、荷木、乌桕、苦楝、格木、柚、橄榄、马尾松、红楝子、垂柳、仁面子、无花果、黄牙果、山肺、鸭脚木等 。 竹 主要有：簕竹、篱竹、篙竹 。 药用植物 野生中药材主要有：海金沙、狗脊、骨碎补、淡竹叶、芦根、香附、水菖蒲、石菖蒲、广东狼毒（野芋头）、半夏、天门冬、土伏苓、草解（土太）、山药（淮山）、羌黄、莪术、郁金、草蔻（草扣仁）、石楠藤、榕树须、穿破石、五指毛桃、桑寄生、火炭母、地肤子、青葙子、倒扣草、茨实、宽根藤、荜澄茄、金樱子、金樱根、蛇泡勒、草决明、金钱草、皂角、葫芦茶（葫芦叶）、千斤拔（老鼠尾）、葛根、入地金牛、三丫苦、鸦胆子、苦楝皮、紫荆皮、岗梅根、救必应、毛冬青、无患根、铁包金、布楂叶、海桐皮（木棉树皮）、木棉花、山芝麻、半枫荷、红水葵、了哥王、天香炉、鸭脚树皮、蛇床子、紫花杜鹃、白花茶、马鞭草、五指金、半枝连、益母草、防风草、颠茄根、穿心莲、车前草、白花蛇舌草、杞子（山枝子）、络石藤、党参、半边莲、广东刘寄奴、田基黄、广东土牛藤（土牛七）、鹅不食草、苍耳子（粘头芒）、莶草（虾钳草）、旱莲草（白花蟛蜞菊）、九里明（千里光）等 。
