公司因组织架构调整，需将部分员工办公地点由总公司调动至项目地办公，但调岗后的办公地点也在当初签署合同的范畴内，该员工岗位及薪资也未发生变化，且调动之时未表示异议。
在项目地上班工作3个月后，因不能忍受项目上轮休及工作量的增加，未经公司同意擅自离岗回公司总部上班，请问针对此类员工，公司能以什么方式管制约束此类员工，如沟通未果，公司是不是不能以员工不服从公司调配而解除劳动合同？此类解除是否还应支付经济补偿金？
备注，该员工劳动合同中有约定：合同变更经双方协商一致后，可在劳动合同变更书中变更。如双方未进行书面变更，但事后双方都实际履行了变更的事项，则视为双方都接受该变更。