1．演化经济学的基本假设体现了其基本方法论观点，是演化理论体系分析的起点。复杂行为人、心智重要和满意假设是关于经济主体方面的假设。演化理论在个人方面的描述考虑了生物学，个人人格假设与达尔文主义是相配合的。演化经济学激烈反对简单化的“经济人”假设，吸收了大量行为主义的思想，注重人的本能和社会习惯、制度的影响。由于人本身就是物理系统、生物系统和社会系统的产物，所以将人格假设置于复杂的层级系统中去考察，是演化经济学基本的分析前提。“心智重要”是演化经济学最基本的本体论假定。心智是实在的一部分，但却是自主的部分。心智与导致心智变化的世界之间存在着交互作用。演化理论对于学习和知识的关注，比新古典经济学完全理性的假设更具有现实意义。满意假设与心智重要假设相关，否定了最大化假设，也就使得某些经济学通用的最大化模型失去使用价值，使得某些常用的数学工具变得难以应用。
不确定性、多样性假设和“历史重要”假设是关于经济环境和世界状态的假设。相对于新古典经济学抽象的、简化的、机械的、确定性的世界观，演化经济学把经济世界看作复杂的系统，正是不确定性、专家问的意见分歧成为增长过程的标志。多样性假设是演化赖以发生的基础，比如，从演化的宏观角度，梅特卡夫将演化的逻辑过程表述为多样性的再创生、多样性的减少(选择和路径依赖过程)和减少了的多样性(出现稳定结构)三个阶段。历史重要假设突出了时间对社会经济系统最基本的建设性作用，演化意味着新质要素随时间的流逝而创生。时间是达尔文主义的基本要素，引入不可逆的时间就强调了演化分析与静态均衡分析的重要区别。
总体而言，演化经济学的假设比主流经济学的假设更具现实性。更具现实性的假设的优点是从研究起点上容易得到证实。但在研究过程中，如何将极其复杂的主体与世界状态结合起来，从而发现其中的规律性，却是个难题。由于在研究过程中不可避免地要进行抽象，演化经济学的研究过程和结论也必然会导致某些非现实性和难以检验性。如果说主流经济学是从非现实性的假设出发，构建理想的模型，并将其结论和预测性与现实相对照，是一个逐步从理想状态走向现实状态的过程，那么，演化经济学则是一个从现实状态出发，去不断抽象和把握经济运行的规律性的过程。所以，主流经济学便于构建完整的系统的经济理论模型，而演化理论却容易出现各种分歧，难以形成统一完备的理论体系，在同一范式下的科学共同体也难以达成共识。
2．演化经济学的具体方法是构建演化理论的技术手段，体现了其基本方法论和假设。个体发生与系统发生方法可以广泛运用到应用性研究之中。比如，我们研究企业组织结构、企业的惯例、企业中人们的关系，那么，我们眼中的企业变迁就是一个系统发生过程。如果我们研究产业的变迁，考察企业之间的相互关系，那么，企业就是个体选择单位，企业变迁便被看作是个体发生过程。注重历史分析的方法与达尔文主义和“历史重要”的假设相一致，地理相对性分析方法与多样性假设相一致。注重地理和历史分析，并不是否认人类社会所共有的社会经济规律，只是强调经济趋势的历史暂存性和地方化条件。就比较法来说，经济事物多样性与差异性的存在是其前提。在经济研究中，各国经济制度、企业模式、经济发展等诸多方面都可以广泛地采用比较的方法。就动态分析法来说，是和达尔文主义以及历史重要假设相一致的。动态分析方法与历史分析方法很相似，但并不能等同于历史分析方法。历史分析方法注重研究对象的历史脉络和路径依赖性，往往适用于具体的历史条件下的具体研究对象，比如我们去研究美国企业模式或日本企业模式。动态分析方法则可以适用于比较抽象的模型中。比如，纳尔逊和温特在经济变迁的研究中，并没有指明具体的国家和历史阶段，而是将企业、行业和经济变迁表述为一种马尔科夫过程，考察它们的经营过程、搜寻过程和选择过程，在演化模型中贯穿了动态分析方法。由于具体方法终究是一些技术手段，并不能显示理论的内涵，所以，相同的技术手段可以在不同的分析范式中使用，不同的理论体系可以相互借鉴其具体方法。
3．演化经济学的基本假设和具体方法为我们提供了新的研究思路和工具。科学的进步是一个不断猜测和反驳的过程，必然充满了争议和辩论。主流经济学和异端经济学之间的持续不断的争论，促使人们不断思考和修正理论假说。目前，在中国经济学研究中，马克思主义经济学和现代西方主流经济学占据着主导地位，演化的思想和研究方法无疑为我们展现了一个不同的视角。如果我们抛弃成见，汲取不同理论范式的精华，将有利于开拓研究思路，提高研究水平。采用演化经济学的研究工具，可以对中国经济问题进行新的思考，有些学者也已经在这方面作出了有益的探索。
