生物技术：泛指在生物所有活动研究过程中运用的可以展示规律并且人类可认知的技术。生物技术是研究生物科学理论、得出生物客观规律的工具之一。
生物工程：是生物科学理论、生物技术及其他行业科学知识(例如机械设计制造及自动化、过程装备技术)的集合。目的就是为了大规模、自动化、智能化展现生物科学理论和生物技术。生物工程是生物科学理论，生物技术产业化的保障。
生物工程偏应用，生物技术偏理论。以本科为例，生物工程毕业生基本掌握发酵、生物分离等与实际生产相关的技术，可以直接上酒厂、酱油厂、醋厂、抗生素制药厂等领域用。生物技术可能更加偏向于微生物检测、分子工程等方面，一般会去生物公司做实验技术员。两个专业毕业待遇应该差不多，生物功能可能高些。如果是本科，我建议选择生物工程；研究生的话，两个专业差不多。