睦剧的曲调种类丰富，据统计，目前能谱曲的专业人士寥寥可数，他们大多集中在淳安，且大部分已年事已高。其唱腔主要分为"湖广调"、"三脚调"和"杂调"三大类别，总数超过一百首。
"湖广调"主要用于大型戏剧，其音乐结构属于板式变化体，基础是[平板]，发展出了[头]、[回龙]、[紧板]、[煞板]和[插句]等板式。[平板]的唱词特点为七字或十字对偶句，音乐以五声音阶的宫调式为主，上句常落"2"（偶落"5"），下句落"1"，节奏为一板一眼或一板三眼。[头]作为唱腔的首句，是[平板]的变体，开头散唱，旋律在重复末尾四字时会临时移宫至"4"，最终归于"土"音。
[回龙]是[头]的延伸，可与[头]配合，也可作为[平板]的尾句，特征在于句逗间常有拖腔。[紧板]是[平板]的紧凑形式，无眼，节奏为四分之一。早期的[平板]和[紧板]只有上下两句，后来发展为四句。[平板]的落音顺序是"5-1-2-1"，而[紧板]为"5-3-2-1"。[煞板]是对[平板]或[紧板]下句的变体，通过锣鼓的加入结束腔调。[插句]则是从[平板]过渡到[紧板]的桥梁，通常以落"2"音的上句出现。
"三脚调"多用于小戏，60余首，部分唱腔有剧种特色，如[种麦调]仅用于《南山种麦》等。[三脚调]中的[大、小反惰]等唱腔，词格多样，风格自成一派，与民间小调有别。过去，艺人们根据节奏和口语性，将唱腔分为[平板]、[急板]和[搭子板]，并结合剧名或原有小调名称，如[补背褡平板]等。
"杂调"主要用于插曲，如宗教音乐的[伸冤调]、[请五方]等，以及婺剧的[滩簧急板]和徽戏的[乱弹调]等。[二黄急板]与"湖广调"和[大、小反情平板]相似，可以相互衔接。
所有这些唱腔不分男女，舞台语言采用当地的六声调值和中州韵，演唱时有锣鼓过门。睦剧团成立后，引入了中、西管弦乐器，并对男、女分宫和角色分腔进行了探索。
睦剧是清末明初时淳安形成的一种山区地方剧种。剧目内容大都反映家庭生活，曲调主要是湖广调和三脚调，并伴以锣鼓之类的打击乐器；演出角色以小生、小旦、小丑为主，群众称之为“三脚戏”。由于它以当地语言为道白，表演风格淳朴粗犷、活泼风趣，富有浓郁的乡土气息，盛行不衰。1951年，淳安首次举办三脚戏艺人讲习班，将三脚戏改名为睦剧。经整理改编演出的睦剧传统剧目有《南山种麦》、《牧牛》、《看花灯》、《补背褡》等。