抚顺市国家税务局系统设置9个县（区）国家税务局，其中设置6个区国家税务局，分别是：抚顺市新抚区国家税务局、抚顺市东洲区国家税务局、抚顺市望花区国家税务局、抚顺市顺城区国家税务局、抚顺市经济开发区国家税务局、抚顺市胜利工业开发区国家税务局，均为国家副处级（本市正处级）全职能局；设置3个县国家税务局，分别是:辽宁省抚顺县国家税务局、辽宁省新宾满族自治县国家税务局、辽宁省清原满族自治县国家税务局，均为正科级全职能局。
根据工作职责，县（区）局相应设置内设机构、直属机构、派出机构和事业单位。
（一）、内设机构
除胜利工业开发区国家税务局外，其他县（区）局内设机构10个，区局的内设机构级别为正科级，县局的内设机构级别为正股级。具体名称如下：办公室、政策法规科、收入核算科、纳税服务科（办税服务厅）、征收管理科、税源管理一科、税源管理二科、税源管理三科、人事教育科、监察室，另设机关党委办公室。
胜利工业开发区国家税务局内设机构7个，级别为正科级。具体名称如下：办公室、政策法规科、收入核算科、纳税服务科（办税服务厅）、征收管理科、人事教育科、监察室。其税源管理职责并入征收管理科，机关党委办公室职责并入人事教育科。
1办公室
拟订本单位年度工作计划、有关工作制度；起草和审核重要文稿；负责机关文电、机要、会务、档案、督办、信息、调研、信访、保密、密码等；承担面向社会的税收宣传、新闻发布及机关政务公开、政府信息公开工作；承办网站运行和维护工作；组织税收科研、学术交流工作；办理人大代表建议和政协委员提案的有关事项；管理本单位财务、政府采购、后勤保障等机关行政事务工作；组织实施综合行政管理信息系统；协助领导对有关工作进行综合协调；承办领导交办的其它工作。
2政策法规科
负责货物和劳务税、所得税等税种的税政业务；管理增值税专用发票；负责金税工程相关税种业务的管理、推广应用及认证报税、数据采集、稽核管理工作；负责相关税种的纳税评估办法、日常稽核和日常管理性检查工作；负责税收协定执行、反避税实施、外国居民税收监管、情报交换、国际税务管理合作等；负责涉税法律事务；负责组织对税收法律、法规执行情况进行日常管理性监督检查；承办重大税收案件的审理和行政处罚、听证工作；负责税务行政诉讼和行政复议等事项；负责对出口货物退（免）税相关业务申报的初审、审核，组织落实本地出口货源征税情况并负责对外复函；牵头抓好依法治税和依法行政工作，拟定依法治税和依法行政工作方案并组织贯彻实施；开展税收政策调研与税收政策执行情况评估反馈工作；开展世贸税收调查应对工作；承办领导交办的其它工作。
3收入核算科
牵头编制年度税收计划；监督检查税款缴、退库情况；开展税收收入分析预测、税收收入能力估算及重点税源监控、企业税收资料调查工作；承担税收会计核算、统计核算、税收票证管理等相关工作；承担税收收入数据的综合管理应用工作；承办领导交办的其它工作。
4纳税服务科（办税服务厅）
负责组织、协调和指导本单位各部门、各税种、各环节的纳税服务工作；负责组织实施纳税服务工作规范和操作规程；负责组织落实纳税人权益保障规章制度及规范性文件；负责组织协调、实施纳税辅导、咨询服务、税收法律救济等工作，受理纳税人投诉；负责指导税收争议的调解；承担短信系统的运行管理工作；组织实施面向纳税人的税法宣传；组织实施税收信用体系建设。
负责纳税人到税务机关办理的各种涉税事项，包括税务登记、纳税申报、税款征收、税款解缴、欠税公告、发票购销、金税发售、报税稽核、咨询辅导和受理减免申请及有关优惠政策申请等；承办领导交办的其它工作。
5征收管理科
组织落实综合性税收征管法律法规、部门规章及规范性文件，拟订具体操作办法；承办征管质量考核、风险管理和税收收入征管因素分析工作；承担税务登记、纳税申报、税款征收、税收资料管理、普通发票管理、税控器具和征管软件的推广应用等方面的相关工作；组织落实个体和集贸市场税收征管、税收管理员制度；组织实施综合性纳税评估办法；承办领导交办的其它工作。
6税源管理科
负责对所辖税源的监控管理工作，对辖区内纳税人实行分类管理和纳税服务；负责所辖纳税户税务登记及纳税申报的调查核实、进行税源预测和分析、重点税源管理跟踪监控、税收调研、日常检查、户籍管理、政策送达、定额核定、催报催缴、数据采集分析、组织实施纳税评估、处理一般性违规违章行为等；承办领导交办的其他工作。
7人事教育科
组织落实干部人事管理制度；承担机构编制、干部任免、人员调配、劳动工资、人事档案、公务员管理、专业技术职务管理等人事工作；组织落实税务人才队伍建设规划，拟订具体实施方案；拟订并组织实施人员培训、学历教育工作规划、年度计划，开展培训质量考核与评估；负责离退休干部的服务和管理工作；负责机关和系统目标管理考核工作；承办领导交办的其它工作。
8监察室
组织落实纪律检查、行政监察工作制度，拟订具体实施办法；组织协调本单位的党风廉政建设和反腐败工作；受理对本单位工作人员违法违纪行为的检举、控告及有关申诉；查处本单位工作人员违法违纪案件及其他重要案件；开展执法监察和纠风工作；承办领导交办的其它工作。
机关党委办公室
负责思想政治工作、精神文明建设、税务文化建设和基层建设；负责党建、工会、共青团、妇委会工作；承办领导交办的其他工作。级别与内设机构的机构级别相同。
（二）．县局直属机构
辽宁省新宾满族自治县国家税务局、辽宁省清原满族自治县国家税务局设置稽查局，级别为副科级。
稽查局内设机构5个，分别是：办公室、综合选案股、检查股、案件审理股、案件执行股，级别为副股级。举报中心工作职责划入综合选案股，挂举报中心牌子。
稽查局职责：组织落实税务稽查法律法规、部门规章及规范性文件，拟订具体实施办法；组织、协调税收违法案件的查处、审理和执行工作；受理税收违法案件的举报；协调公安、检察、审判机关处理税务稽查有关工作；承担金税工程发票协查工作；牵头组织税收专项检查工作和税收专项整治工作；办理税收违法案件的立案和调查的有关事项并提出审理意见。
内设机构职责参照市局所属稽查局设置。
（三）．派出机构
县（区）局设若干税务分局、税务所。区局设置的税务分局、税务所级别为正科级；县局设置的税务分局级别为副科级，税务所级别为正股级。
（四）．事业单位
县（区）局设信息中心，级别与内设机构的级别相同。
信息中心职责：承担本单位信息化建设的技术支持、保障工作；承担税收管理信息系统的运行维护工作；组织本单位信息安全管理与实施。
