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转录组测序结果怎么看
转录组测序
获得的unigene序列
怎么
扩全长
答:
分析
测序结果
,筛选出与皮肤生长发育相关的基因。将样本的有效reads合并,通过测序总共获得377,618条Unigenes,Unigenes的平均长度是680nt,最长的序列长达
转录组
谜团
答:
看过这个就明白了:方案很多,几十上百个软件供你选择,其中好用的有很多,但是不会有最好的流程,只有自己搭配出适合自己的。 与其选择流程,不如熟悉原理 ,在
结果
不合常理时知道
怎么
去纠正。
转录组
的基本流程用两套方法就能熟悉过来。一般就是:质控-》比对(alignment or mapping)-〉估算表达量(...
做
转录组测序
以后,还需要进行
怎么样
的分析?请尽量回答的详细一点,谢 ...
答:
之后的分析就要根据研究目的,分析
转录组
之间的差异与相关性了。这后面的分析应该是因人而异了。可以看看相关文献中是
如何
分析的。
转录组测序
多久可以拿到报告
答:
转录组测序
最快10个自然日可以拿到报告。转录组广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,快速转录组仅需12个自然日(12天=建库+测序+分析周期),而安诺可以7天完成
转录测序
,使快速转录组10个自然日完成。
如何
测量RNA的纯度和含量
答:
RNA胶(凝胶成像)检测。例如:原核生物的核糖体所含的rRNA有5S、16S及23S三种。在胶上就有三条明显大小不一的条带。凝胶迁移分析。可以用来研究RNA-蛋白相互作用。基本原理是:结合了蛋白的RNA在凝胶中的迁移速率更慢,因而可以区分出结合蛋白与未结合蛋白的RNA条带。RNA-seq即
转录组测序
技术,把mRNA...
转录组测序
的大致流程?我们要测某个菌在进行某一个反应期间的转录组...
答:
以真核
转录组测序
为例,实验流程为总RNA提取-mRNA分离-建库试剂-定量-文库回收-桥式扩增-上机测序;项目分析流程为数据产出数据=数据去杂-转录组拼接-SSR分析及SNP分析-基因功能注释-基因表达差异分析-差异基因表达模式聚类-差异基因富集分析。
怎么
从
转录组
数据中筛调控萜类的转录因子
答:
基因表达谱测序是直接对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA进行高通量测序,可以用来研究基因的表达差异情况。该技术结合了
转录组测序
建库的实验方法,与转录组测序相比,基因表达谱测序要求的读长更短,测序通量更小,但仅可用于基因表达差异的研究。转录组测序是RNA水平测序,相当于DNA水平的...
如何
来设定
转录组测序
中的生物学重复
答:
由此可知,设计的实验如果没有生物学重复,或者生物学重复的数量不够,就不能得到有统计意义的实验
结果
;获得的差异表达的基因很可能仅仅是少数个体差异的表现,并不能反映疾病或者某种特定生理状态的群体本质特征。3.生物学重复设置几个合适?您是不是有同样的问题:
转录组测序
是否必须进行生物学重复啊,...
全基因
组测序
技术
答:
问题五:全基因
组测序
的研究
结果
①NCI-H209细胞系基因组中,共检测到22,910个碱基替换、65个插入缺失(Indels)、58个结构变异;在基因组的编码区,除了发现RB1 和TP53基因发生点突变和MLL2基因由于发生了G>T的颠换,从而产生了pre-stop codon外,有94个点突变直接改变了氨基酸序列,有36个属同义突变。②特定的碱基及...
什么是
转录组测序
分析中Unigene?求标准答案,最好有答案相关文献来源...
答:
Unigene其实没有一个标准的定义。大体的概念是经过去冗余之后得到的基因序列,这条序列和其他的序列是非冗余的,也就是理论上其他序列都和此序列代表的不是同一个基因。或者是经过聚类后得到的不同的类,类和类之间是非冗余的,每个类可以认为唯一的代表一个基因。不同的去冗余和聚类的方法得到的
结果
都...
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