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转录组测序的原理及步骤
转录组和
蛋白质组有何异同之处
答:
组学omics,研究的是整体.按照分析目标不同主要分为基因组学,
转录组
学,蛋白质组学,代谢组学.基因组学研究的主要是基因组DNA,使用方法目前以二代
测序
为主,将基因组拆成小片段后再用生物信息学算法进行迭代组装.当然这仅仅是第一步,随后还有繁琐的基因注释等数据分析工作.转录组学研究的是某个时间点的...
混合(Pooling)样本
测序
研究
答:
BSR(Bulked segregant RNA sequencing)同样依据分组混合
的原理
,在RNA水平上进行高通量测序并定位候选基因,即BSA+RNAseq。BSR的混池同样选取分离群体中的极端性状单株,混池用的单株数会比BSA多一些(大多大于30),提取RNA进行混池,再进行
转录组测序
,mapping参考基因组后同样进行变异分析,确定候选区间...
做dna
测序检测
会不会特别麻烦?
答:
目前DNA
测序技术
已经非常成熟了,有现成的抽提试剂盒和建库试剂盒,非常方便的。需要注意的是:1、应该根据自己的需求制定合理的实验,比如想要做WES外显子测序、全基因组测序,那么收集样本,试剂盒抽提质检文库构建,送测就可以了。2、如果是想研究
转录组测序
、全转录组测序、miRNA测序,这是抽提RNA,...
单克隆
测序是什么
意思?
答:
单克隆测序(Single Cell Sequencing),顾名思义,是指对单个细胞进行的基因组或转录组的测序分析。单个细胞可以是体内的任何类型的细胞,如血细胞、肌细胞、神经细胞等。与传统基因组或
转录组测序
分析相比,单克隆
测序的
分辨率更高,可以在单个细胞的水平上研究基因表达和功能,从而更加深刻地理解生命的...
转录组
最常见的几个问题
答:
转录组是指某个物种或特定细胞在某一生理功能状态下,细胞内所有转录的mRNA产物的集合,包含了时间和空间的限定,是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的必然纽带。转录水平的调控是目前研究最多的,也是生物体最重要的调控方式。应用高通量技术进行
转录组测序
是一种快捷可靠的获取转录组信息的方法。mR...
如何来设定
转录组测序
中
的
生物学重复
答:
如何来设定
转录组测序
中的生物学重复 1.区分生物学重复与技术重复 生物学重复:指样本重复,比如3只小鼠,同时做一种处理,就是三个生物学重复。技术重复:一般是三次实验,比如对一块组织,提了三次RNA,做三次real time。2.设置生物学重复的意义 由于新一代
测序技术的
优越性以及高成本,曾一度忽略...
如何利用代谢组学结果画代谢通路
答:
相信很多做过
转录组测序的
老师都深有体会。总感觉中间缺少了一步?没错,就是代谢物!代谢物是基因型与表型之间的桥梁,代谢物的变化更能直接揭示基因的功能,因此能够更有效地揭示生物学及其生化、分子
机理
。在植物研究中,目前代谢组+转录组的策略已经被广泛运用于植物生理、生长发育、及逆境胁迫研究中...
高通量
测序
分
的原理
是什么?
答:
3.高通量
测序技术
是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种
的转录组和
基因组进行细致全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测序(deep sequencing)。
高通量
测序技术
是什么?
答:
对有参考序列的物种,进行全基因组重测序(resequencing),在全基因组水平上扫描并检测突变位点,发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全
转录组测序
(whole transcriptome resequencing),从而开展可变剪接、编码序列单核苷酸多态性(cSNP)等研究。或者进行小分子RNA测序(small RNA sequencing),通过...
目前用于
测序的
技术主要有哪些?
答:
DNA的序列分析是进一步研究和改造目的基因的基础。目前用于
测序的
技术主要有Sanger等(1977)发明的双脱氧链末端终止法与Gilbert(1977)发明的化学降解法。这两种方法在
原理
上差异很大,但都是根据核苷酸在某一固定的点开始,随机在某一个特定的碱基处终止,产生A,T,C,G四组不同长度的一系列核苷酸,...
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