66问答网
所有问题
当前搜索:
转录组测序的原理及步骤
全面
转录组是什么
意思?
答:
全面
转录组
是一种高通量技术,可以研究某个生物体或组织中所有的RNA分子。它是对RNA分子的全面
测序
,是一种非常强大的生物信息学研究方法。通过全面转录组,可以全面探索生物体或组织中RNA的数量、种类和表达水平等信息,为我们的生物学研究提供重要的支持。全面转录组是研究生物进化、表型特征、分子调节机制...
连锁不平衡
以及
连锁不平衡衰减
答:
LD衰减图就是利用曲线图来呈现基因组上分子标记间的平均LD系数随着标记间距离增加而降低的过程。大概的计算
原理
就是先统计基因组上两两标记间的LD系数大小,再按照标记间的距离对LD系数进行分类,最终可以计算出一定距离的分子标记间的平均LD系数大小。如图3是黄瓜重
测序
文章中统计各个亚群体的LD衰减速度的图形。横坐标...
求教
转录组测序检测
可变剪切的问题
答:
因为Illumina
测序的
读长短,如果是single end测序,匹配和拼接都比较困难。paired-end测序虽然无法测通整个片段(一般是300-500 bp),但加上pair的信息,分析的可靠性相对要好很多。不过paired-end测序基本都不是strand specific的,在一些特定的场合,比如要分析natural antisense transcript的时候就不合适了。
转录组测序
可以用来凑数据吗
答:
转录组测序
可以用于凑数据,但需要注意以下问题:1、参考基因组的质量会影响转录组的注释效果,如果参考基因组质量不高,会导致转录组注释的可变剪切和转录本数目不准确。2、转录组测序需要设置多个生物学重复样本进行分析,如果某个样品与其他样品相关性不好,可以将该样本剔除并进行差异分析。3、转录组测序...
巨集基因
组测序
都能得到那些结果?可以用于什么研究?
答:
巨集基因
组测序
,是对特定环境(或者特定生境)样品中的微生物群体基因组进行序列的测定,以分析微生物群体基因组成及功能,解读微生物群体的多样性与丰度,探求微生物与环境,微生物与宿主之间的关系,发掘和研究新的、具有特定功能的基因。巨集基因组测序研究避开了微生物分离培养的过程,扩充套件了微生物资源的利用空间,为...
做
转录组测序
以后,还需要进行怎么样的分
答:
首先需要做的是将测出来的reads mapping到基因组上,与此同时可以得到数据mapping比例等信息,依靠这些信息可以进行数据质量的分析,然后还可以统计每个基因的表达情况,如果是比较不同样本之间
的转录组
,则可以进行差异表达基因的分析
什么是
转录组测序
分析中Unigene
答:
简单地说, 高通量
测序
时,在芯片上的每个反应,会读出一条序列,是比较短的,叫read,它们是原始数据; 有很多reads通过片段重叠,能够组装成一个更大的片段,称为contig; 多个contigs通过片段重叠,组成一个更长的scaffold; 一个contig被组
数据在线绘图-亿图如何绘制uml数据
答:
8.其他课程链接:二代
测序转录组
数据自主分析、NCBI数据上传、二代测序数据解读。亿图如何绘制uml数据 时序图绘制
步骤
使用「亿图图示」软件(需提前安装)绘制时序图,只需要4个步骤,具体内容如下所述: ①运行软件,开启绘图 双击启动软件,依次点击“新建”-“软件”-“UML模型图”-“创建”。 ②绘制UML时序图 在左侧...
宏
转录组
宏基因组
有什么
区别
答:
因此,基因组应该指单倍体细胞中包括编码序列和非编码序列在内的全部DNA分子。说的更确切些,核基因组是单倍体细胞核内的全部 DNA分子;线粒体基因组则是一个线粒体所包含的全部DNA分子;叶绿体基因组则是一个叶绿体所包含的全部DNA分子
转录组
(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录...
转录组
转录组测序
与基因表达谱的区别?
答:
转录组测序技术
是一种高通量技术,旨在测定mRNA、smallRNA以及NONcoding RNA等多种类型的RNA序列,旨在快速全面地揭示一个物种特定器官或组织在特定状态下所有转录本的组成。它能反映出这些RNA分子的表达水平,从而提供基因活动的动态视图。相比之下,基因表达谱的构建则更为精细。它通过创建非偏性的cDNA文库...
棣栭〉
<涓婁竴椤
14
15
16
17
19
20
21
22
23
涓嬩竴椤
灏鹃〉
18
其他人还搜