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转录组差异基因特别多
转录组
和蛋白质组有何异同之处
答:
组学omics,研究的是整体.按照分析目标不同主要分为
基因组
学,
转录组
学,蛋白质组学,代谢组学.基因组学研究的主要是基因组DNA,使用方法目前以二代测序为主,将基因组拆成小片段后再用生物信息学算法进行迭代组装.当然这仅仅是第一步,随后还有繁琐的基因注释等数据分析工作.转录组学研究的是某个时间点的...
转载---[
转录组
] 转录组专题——关于样本重复性问题小技巧
答:
目前,
转录组
测序仍是应用最广的高通量测序技术之一,很多研究课题是关于
基因
表达潜在的机制,并已经发现了一些现象,但分子机制还不清楚。而做转录组测序
特别
适合用于分子机制探究,可以获得样本中几乎所有的mRNA信息。关于转录组领域的研究,应用范围极为广泛。如可研究同一个体不同组织之间的基因表达
差异
;或者不同的外界处理...
怎么知道测序数据是
转录组
还是
基因
答:
怎么知道测序数据是
转录组
还是
基因
转录组学的研究对象包括mRNA和非编码RNA等。新一代高通量测序技术可以全面快速地获得特定细胞或组织在某一个状态下几乎所有转录本的序列信息和表达信息,从而准确地分析基因表达
差异
、基因结构变异、筛选分子标记(SNPs或SSR)等生命科学的重要问题。基因表达谱测序是直接对某...
无参
转录组
怎么确定
基因
答:
以下步骤:1、对来自未确定参考
基因组
的物种样品的
差异基因
进行
转录组
分析,以获取包括多个
基因差异
的差异基因列表,并获取预先生成的去除重复基因序列的基因序列文件。2、对上述基因序列文件进行解析以确定多个基因序列,为每个基因进行通路注释,从而生成经过注释的基因序列文件。3、根据经过注释的基因序列文件...
转录组
生物信息学分子时怎么知道有没有参考
基因
答:
而”生物信息学“这个领域的划分,则是由研究方法”信息学“决定的。因此凡是运用到信息学方法研究的生物学问题都可以算是生物信息学,例如
基因组
序列分析、RNA和蛋白质结构预测、蛋白质相互作用网络构建和分析等。所以综上所述,我不是很同意另一个回答”基因组学是生物信息学的一个分支“的说法。我...
如何快速从
转录组
数据中筛选目标
基因
!
答:
以上是利用基因ID在总表中查找一列信息,比较简单。如果我们想查找多列信息该如何操作呢?方法相似,我们可以在总表中插入deg_gene列,然后去
差异基因
表中查找基因ID即可,具体操作如下:到这里,一个简单的Excel表筛选基因信息的方法就介绍完了,实际上在公司给出
转录组
标准分析之后,很多个性化都可以由...
利用
转录组
可以做目的
基因
的基因共表达分析吗
答:
尽管有许多意外的情况存在,大量功能相关的
基因
的确在相关的一组条件下有
非常
相似的表达谱,
特别
是被共同的
转录
因子共调控的基因,或者产物构成同一个蛋白复合体,或者参与相同的调控路径.因此,在具体的应用中,可以根据对相似表达谱的基因进行聚类,从而指派未知基因的功能.
干货:5千字解密
转录组
发高分常见应用场景(含推荐样本数) | 转录调控专...
答:
机制类论文开始采用
转录组
测序替代传统的qPCR和WB实验,作为一种经济高效的方法。通过转录组测序,可以批量筛选目标基因和关键通路,加快实验进程。转录组测序的生物学重复数量通常根据研究目的和样本类型而定。
差异基因
筛选和功能富集分析是转录组测序的常见应用场景之一,这类分析通常从实验组与对照组的基因...
[
转录组
] 生物学重复到底设定多少个合适
答:
这个是
非常
有意思的问题,我提供的建议非常有限,期望其他人有更好的回答。“虎式坦克”的回答不错。关于生物学重复与统计的关系,我补充一下。在我们的测序样本中,每一个
基因
表达量的方差包含两个方面的内容:1)处理方差,就是我们的实验处理导致的
差异
,这些差异当然就是我们关注的;2)误差方差,就...
转录组
测序和全转录组测序的区别
答:
转录组
测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有mRNA。转录组测序能够从整体水平研究
基因
表达量以及基因结构,揭示特定生物学过程中的分子机理。目前已广泛应用于基础研究、临床诊断、药物研发等领域。同时获得样本的转录本结构和转录丰度信息 探究疾病相关基因结构变异 挖掘
差异
表达基因分析...
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