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转录组学的研究应用
转录组学
测序是对mrna测序吗
答:
转录组学的研究
对象包括mRNA和非编码RNA等。新一代高通量测序技术可以全面快速地获得特定细胞或组织在某一个状态下几乎所有转录本的序列信息和表达信息,从而准确地分析基因表达差异、基因结构变异、筛选分子标记(SNPs或SSR)等生命科学的重要问题。 基因表达谱测序是直接对某一物种或特定细胞在某一功能...
...
转录组学
、蛋白质组学和代谢
组学的
概念、
研究
方法、优缺点及
应用
设想...
答:
基因组学研究的主要是基因组DNA,使用方法目前以二代测序为主,将基因组拆成小片段后再用生物信息学算法进行迭代组装。当然这仅仅是第一步,随后还有繁琐的基因注释等数据分析工作。
转录组学研究
的是某个时间点的mRNA总和,可以用芯片,也可以用测序。芯片是用已知的基因探针,测序则有可能发现新的mRNA,...
转录组学的
技术发展
答:
SAGE可以定量分析已知基因及未知基因表达情况,在疾病组织、癌细胞等差异表达谱
的研究
中,SAGE可以帮助获得完整
转录组学
图谱、发现新的基因及其功能、作用机制和通路等信息。MPSS是对SAGE的改进,它能在短时间内检测细胞或组织内全部基因的表达情况,是功能基因
组研究
的有效工具。因其需要配套的软硬件较为昂贵...
研究
进展 | 植物单细胞文章及其思路集锦
答:
植物单细胞
转录组
测序(sc RNA-seq)自2019年问世以来,已经被
应用
到植物细胞图谱、植物器官发育等领域
的研究
中。目前植物单细胞的研究大多是以细胞分群和差异基因分析为基础,进而解析细胞发育及其调控机制,再深度探究非生物胁迫环境下细胞的响应机制。受技术水平的限制,植物单细胞研究初期的物种仅局限于...
什么是HTS?
答:
HTS技术在许多领域都有广泛的
应用
。在基因组学
研究
中,HTS技术被用于人类基因组测序、单基因遗传病诊断、肿瘤基因组学研究和物种基因组测序等。通过HTS技术,研究人员能够发现与疾病相关的基因变异、揭示基因组的结构和功能,并为疾病的预防和治疗提供新的思路和方法。除了基因组学研究,HTS技术还在
转录组学
...
如何分析
转录组学
中的gene
答:
分析
转录组学
中的gene:转录组测序可以得到大量差异表达基因和调控代谢通路,但由于基因与表型难以直接关联,导致关键信号通路难以确定,因此往往达不到预期
研究
目的。代谢物是基因型与表型之间的桥梁,代谢物的变化更能直接揭示基因的功能,因此能够更有效地揭示生物学及其生化、分子机理。在植物研究中,目前...
10X空间
转录组
数据分析梳理
答:
在这篇综述中,概述了用于分析空间分辨
转录组学的
现有最先进工具,同时更深入地
研究
了基于 DL 的方法。讨论了该领域的新前沿和未解决的问题,并强调了我们预计转型 DL
应用
的领域。 尽管多细胞生物在其细胞内包含一个共同的基因组, 但细胞的形态和基因表达模式在很大程度上是不同的和动态的。 这些差异源于内部基因...
扩增子、宏基因组、宏
转录组
,三大法宝玩转肠道微生物
答:
宏
转录组
可以
研究
在特定条件下,环境/组织样本中所有的微生物的RNA的集合,利用高通量测序,可以直接获得样本中所有微生物转录组信息,能够从转录水平研究复杂微生物群落变化,挖掘潜在的新基因。三个技术比较如下:如果说扩增子是初步探究样本种微生物群落分布,宏基因组则能更加全面揭示群落物种的功能,而宏...
基因组学,
转录组学
,蛋白质组学哪个更有用
答:
基因组学研究的主要是基因组DNA,使用方法目前以二代测序为主,将基因组拆成小片段后再用生物信息学算法进行迭代组装。当然这仅仅是第一步,随后还有繁琐的基因注释等数据分析工作。
转录组学研究
的是某个时间点的mRNA总和,可以用芯片,也可以用测序。芯片是用已知的基因探针,测序则有可能发现新的mRNA,...
测序相关知识总结
答:
外显子组测序是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。外显子测序相对于基因组重测序成本较低,对
研究
已知基因的SNP、Indel等具有较大的优势,但无法研究基因组结构变异如染色体断裂重组等。
转录组学
(transcriptomics)是在基因组学后新兴的一门学科,即研究特定细胞在...
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