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系统进化树的结果解读
进化树的
序列进化树
答:
构建序列
进化树的
主要步骤是比对,建立取代模型,建立进化树以及进化树评估。 建立一个比对模型的基本步骤包括:选择合适的比对程序;然后从比对
结果
中提取
系统
发育的数据集,至于如何提取有效数据,取决于所选择的建树程序如何处理容易引起歧义的比对区域和插入/删除序列(即所谓的indel状态或者空位状态)。一个...
系统进化树
相关请教高手!!!急等!!!
答:
貌似NCBI说是软件的输入状态不对 You may have accidentally entered an accession number in the search box without changing the input selection from "Sequence in FASTA format" to "Accession or gi". You will also see this error message if too many ambiguity codes (R,Y,K,W,N, etc....
系统
发育基本概念
答:
例如,在菝葜科中,各种形态各异的植物,如木本、草本,直立或攀缘,单花序或复合花序,它们之间的进化关系是
系统
发育研究的核心内容。系统发育学主要关注进化关系的推断,通过分支图表(
进化树
)展示同一谱系的演变,包括分子进化、物种进化以及两者综合
的结果
。尽管系统发育学曾关注形态学特征,但现代研究更...
如何构建
系统
发育树
答:
都不能保证一定能够得到一棵描述比对序列
进化
历史的真实的树。一般地,对于某个数据集,如果用一种方法能推断出正确的
系统
发生关系,则用其它流行的方法也能得到较好
的结果
。但是,如果模拟数据集中序列的变化很大,或不同的分支变化速率不同,则没有一种方法是十分可靠的。
在进化生物学的
系统进化树
中,steps less parsimonious中文翻译...
答:
从字面看是 进步 很少 吝啬 ,我认为应该是在生物的
进化
过程中,各个时期都有显著的差异
进化树
可信度低怎么办
答:
相关介绍:
进化树
建立一个比对模型的基本步骤包括:选择合适的比对程序;然后从比对
结果
中提取
系统
发育的数据集,至于如何提取有效数据,取决于所选择的建树程序如何处理容易引起歧义的比对区域和插入/删除序列。先应用CLUSTALW程序,然后进行手工比对,最后提交给一个建树程序。这个过程有如下特征选项部分依赖于...
如何用MEGA5.0和Clustalx1.83构建
进化树
答:
MEGA是一个关于序列分析以及比较统计的工具包,从3.1版本到后来的4.0版本一直都广为大家熟悉,现在推出了Mega5.0版本。功能比以前多有改进。现主要介绍使用Mega 5.0构建
系统进化树的
方法。供大家参考。用MEGA构建进化树有以下步骤:1、测序:将克隆扩增测序得到的16S rDNA序列进行测序。2、NCBI上做...
单倍型的分子
系统树
怎么构建
答:
可以使用一些常见的序列比对工具(如ClustalW、MAFFT或MUSCLE)进行比对。3、单倍型识别:根据比对
结果
,鉴定出单倍型。一种常见的方法是利用单倍型分析软件(例如DnaSP或PHASE)进行单倍型鉴定。这些软件可以根据个体之间的变异模式来推断不同的单倍型。4、构建系统树:一旦确定了单倍型,可以使用构建
进化树的
方法...
如何利用等位基因频率构建
系统进化树
答:
如何利用等位基因频率构建
系统进化树
将已赋值好的Excel文件放于桌面,假设命名为A.xls,保存为Microsoft office 5.0/95工作薄形式。Excel文件格式设成软件识别的模式,即A1=1,表示出现等位基因;B1=132,表示等位基因数,C1=189表示品种数;D1=0表示不出现等位基因。从A3开始,在第一列标上所有的...
系统
发育树能用在种间吗?
答:
这一过程并不能够直接看到,人们只能通过相关线索了解历史上曾经发生了什么,而科学家就是用这些线索建立各种假说、模型,甚至是生命发生的历史。在
系统
学分类的研究中,最常用的可视化表示进化关系的方法就是绘制系统发育
进化树
(Phylogenetic trees),用一种类似树状分支的图形来概括各种(类)生物之间的亲缘...
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