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Uniprot蛋白数据库
蛋白质数据库
有哪些
答:
蛋白质数据库有以下多个:1. PDB蛋白质数据库 PDB(Protein Data Bank)是全世界最大的蛋白质结构数据库。它包含了大量的蛋白质三维结构信息,这些结构信息是基于X射线晶体学和核磁共振等实验手段得到的。科研人员可以通过该数据库查询蛋白质的结构、功能以及其他相关信息。2.
UniProt蛋白质数据库
UniProt...
蛋白
组学
数据库
知多少?必看
答:
数据库的来源主要包括两个主流资源:
Uniprot
和 NCBI。Uniprot 是全球最全面、使用频率高、冗余度最低的
蛋白质数据库
,由瑞士
蛋白数据库
(Swiss-Prot)、TrEMBL 和 PIR-PSD 三大数据库合并而成。而 NCBI 是基因组研究中最权威的数据库,记录了全球的基因组测序信息,以及转录、蛋白等翻译后的序列信息。
这几个
蛋白质数据库
,你想要的几乎都有!
答:
蛋白质在生命科学研究中占据重要地位,其多样性和复杂性使得收录蛋白质信息的数据库各有侧重。面对众多的
蛋白质数据库
,如何选择合适的数据库寻找所需数据?以下是一些常用的蛋白质数据库,供大家参考。01.
Uniprot
网址:
uniprot
.org 数据:包含各物种基因组测序得到的全基因蛋白质序列,以及文献中的蛋白...
uniprot
和pir家族信息的异同
答:
UniProt数据库
的主要目的是收集生物序列的完整信息,包括
蛋白质
序列、基因序列、基因组序列等,通过这些信息可以构建生物家族树,从而推断出演化关系。而PIR家族信息则主要集中在蛋白质家族的收集和分析上,它收录了大量蛋白质序列,能够从这些序列中推断出家族的演化关系,从而更好的分析和控制这些家族的行为。
蛋白质组学 |
蛋白质数据库
选择决定最终数据质量
答:
在蛋白质组学研究中,选择正确的
蛋白质数据库
如同经济基础决定上层建筑,对数据质量至关重要。人蛋白组研究中,常用的数据库如
UniProt
提供了三个子库:Swiss-Prot(高质量、人工注释)、Proteome(基因组测序物种)和总库Swiss-Prot+TrEMBL。Swiss-Prot以文献和计算验证的高质量数据著称,是已验证的数据库...
蛋白质数据库
的介绍
答:
蛋白质数据库
是指包括蛋白质信息的数据库。常用的蛋白质数据库有很多,其中
Uniprot
被认为收录最广泛和注释信息最全面的蛋白质数据库。Uniprot下包括Swiss-Prot、TrEMBL和PIR-PSD,详见Uniprot_百度百科。其他的
蛋白数据库
有PDB(Protein Data Bank,简称PDB,开始建立于1971年)等。国内也有些如由上海生物...
uniprot
怎么看
蛋白
序列是通过实验获得的
答:
1、首先打开官网,在搜索框前面的选择框中选择“gene”,在后面的搜索框中键入“CD47”,点击search。2、可以在弹出的新页面中查看搜索结果。你可以在这里看到各种相关基因的链接。这里选择单击CD47molecule[HomoSapiens(Human)。3、在弹出的网页上可以看到这种
蛋白质
的概要。4、往下拉,可以看到基因信息、...
如何在
uniprot数据库
中查找某个
蛋白
序列
答:
包括研究1个人群、1个种系产生或描写人群变化的1组组联合序列。PopSet既包括核酸序列数据又包括
蛋白质
序列数据。Entrez 功能强大,在于它的大多数记录可相互链接,既可在同1
数据库
内链接,也可在数据库之间进行链接。当应用BLAST软件比较某氨基酸或DNA序列与库中其他氨基酸或DNA序列差异即进行类似性检索时,...
蛋白质组学 |
蛋白质数据库
选择决定最终数据质量
答:
蛋白质组学研究中,
蛋白质数据库
的选择对数据质量有着决定性影响,正如马克思所述的“经济基础决定上层建筑”。数据库的选择包括人
蛋白数据库
,如
UniProt
提供的Swiss-Prot、Proteome和总库Swiss-Prot+TrEMBL,它们在蛋白质总数、准确性和注释程度上各有差异。Swiss-Prot是高质量、人工注释的,主要来源于文献...
为什么在
uniprot
中一个ID会对应到PDB
数据库
中的多个ID
答:
PDB 是蛋白质复合物的数据库,一个pdb id 往往代表多个蛋白质形成的复合物,或者蛋白质与小分子形成的复合物。而
uniprot
是
蛋白质数据库
,一个id就代表一个蛋白质。考虑到一个蛋白质可能与多个其他蛋白或者小分子组合,因此,不同的pdb中会包含相同的蛋白质,也就是说一个uniprot id会对应多个pdb id ...
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