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RNA提取细胞数
2.单
细胞
RNA
-seq:
计数
矩阵的生成
答:
(STAR) 或轻量级方法 (Kallisto/RapMap) 进行比对。重复的 UMI 被折叠,并且只有唯一的 UMI 使用 Kallisto 或 featureCounts 等工具进行量化。结果输出是一个按基因
计数
矩阵的单元格:矩阵中的每个值代表源自相应基因的
细胞
中的read数。使用计数矩阵,我们可以探索和过滤数据,只保留更高质量的细胞。
dna和
rna
在植物
细胞
和动物细胞中的分布情况。
答:
绝大多数DNA存在
细胞
核的染色体上,只有极少量结构不同的DNA存在于细胞的线粒体和叶绿体中。在细胞中,根据结构功能的不同,
RNA
主要分三类,即tRNA(转运RNA),rRNA(核糖体RNA)和mRNA(信使RNA)。mRNA是合成蛋白质的模板,内容按照细胞核中的DNA所转录,由细胞核合成,通过核孔进入细胞质的核糖体中...
RNA
大量合成是在哪个时期? 4个选项:①G1期 ②S期 ③G2期 ④M期 请解释...
答:
根据现代
细胞
生物学的研究,细胞分裂的间期分为三个阶段:第一间隙期,称为G1期;合成期,称为S期;第二间隙期,称为G2期。G1期的特点:G1期是从上次细胞增殖周期完成以后开始的。G1期是一个生长期。在这一时期主要进行
RNA
和蛋白质的生物合成,并且为下阶段S期的DNA合成做准备。如合成各种与DNA...
目前已知的所有
RNA
,它们的合成场所都在
细胞
核吗?
答:
RNA合成部位涉及它的合成途径:1、由DNA转录产生是最常见的方式,而DNA存在于
细胞
核(或拟核)以及半自助细胞器中。2、RNA病毒遗传物质的复制总结起来有两种:逆转录合成DNA再转录产生新
RNA的
,或直接通过翻译转录复制来合成新RNA链的。逆转录的病毒RNA一般要进入细胞核;而自我复制型的病毒未必需要进入核...
trizol试剂
提取细胞
内总
RNA
时,加入试剂后一定要在4度下离心吗
答:
最好在4度下离心。因为在4度下,
RNA
酶的活性低,总RNA降解的也就越少。在常温下离心RNA比4度更容易降解。
什么生物的遗传物质是
RNA
?
答:
部分病毒的遗传物质是
RNA
。RNA病毒有:艾滋病病毒,烟草花叶病毒,SARS 病毒,MERS病毒,埃博拉病毒(Ebola virus),西班牙流感病毒,甲型H1N1流感病毒,禽流感病毒,噬菌体(有一部分噬菌体是DNA病毒)等。RNA病毒(RNA virus) 也称RNA型病毒。植物病毒,除少数例外(如花椰菜花叶病毒Caulif- lower mosaic...
标准化单
细胞RNA
测序数据—陷阱和建议
答:
单
细胞RNA
测序(scRNA-seq)的目的通常是亚群鉴定和差异基因表达分析。 为避免“维度灾难”(curse of dimensionality),将高可变基因 (HVG) 用于聚类分析。 多项研究表明,HVG对原始
计数
矩阵标准化方法的选择很敏感。 原始read计数不能直接用于比较细胞之间的基因表达,因为它们会被实验技术和“无趣”的生物变异所混淆(干扰...
RNA
干扰的原理是什么?最好有原理图?
答:
siRNA在
细胞
内
RNA
解旋酶的作用下解链成正义链和反义链,继之由反义siRNA再与体内一些酶(包括内切酶、外切酶、解旋酶等)结合形成RNA诱导的沉默复合物。RISC与外源性基因表达的mRNA的同源区进行特异性结合,RISC具有核酸酶的功能,在结合部位切割mRNA,切割位点即是与siRNA中反义链互补结合的两端。被切割...
提取
基因的转录
rna
用什么
细胞
答:
哪些细胞能合成相应的蛋白质,就用哪些
细胞提取
相应的mRNA。例如:要提取胰岛素的mRNA,就要利用胰岛B细胞。
细胞
蛋白和
RNA提取
答:
一般不太建议蛋白和RNA同时提取,培养
细胞提取RNA
可以刮,也可以消化,无论怎样做,尽量缩短操作时间;蛋白提取的话最好刮。
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