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3个基因构建进化树的方法
C值悖论的C值结构
答:
一项对果蝇
基因
组变异模式的研究表明,基因组中绝大部分的变异只能用选择理论解释。更多的研究提示,达尔文意义上的正选择是普遍存在的。相信未来几年中针对各种进化力量对基因和基因组的作用的分析仍然会是一个热门的进化生物学研究方向,并有望结束中性进化论在分子水平的统治地位。
构建
生物系统发育的
进化树
也是进化生物...
用 生物信息学软件 解决 一个生物学问题
答:
(
3
)用查询序列搜索数据库,将找到的条目与查询序列进行对比并产生
进化系统树
克隆并测序一个未知功能
基因的
用户可能希望在一个数据库中搜索相似的序列。如果搜索到了,用户可能进一步希望创建与查询序列最相似的序列的多序列对比并产生数据的种系图。 往SeqLab Editor中添加一个查询序列并从Functions菜单中选取FASTA程序...
结构生物学或计算结构生物学在哪些方面的应用可以为人类造福
答:
分子进化是利用不同物种中同一
基因
序列的异同来研究生物的进化,
构建进化树
.既可以用
DNA
序列也可以用其编码的氨基酸序列来做,甚至于可通过相关蛋白质的结构比对来研究分子进化,其前提假定是相似种族在基因上具有相似性.通过比较可以在基因组层面上发现哪些是不同种族中共同的,哪些是不同的.早期研究
方法
常...
Structure图的
构建
与理解
答:
简单说来,就是要找的一个likelihood最大(越大越可靠)而且K值最小(亚群数最少)的模拟结果,往往这样的模拟对应的K值是最接近于群体的真实情况的。Structure是与PCA、
进化树
相似
的方法
,就是利用分子标记的
基因
型信息对一组样本进行分类,分子标记可以是SNP、indel、SSR… …当然,对于重测序应用的最...
如何利用泛
基因
组来深度发掘一个物种?
答:
通过研究SV和转录组的变化,可以更好的发掘性状背后的
基因
。使用2898个重测序,每个13x,获得了31M个SNP;并且
构建进化树
,将2898个accession分成6个大类。组装结果都还是很好的,见下图。重复序列的占比也都比较稳定,在55%左右,基因数目也比较恒定。定义了softcore gene(存在于25个个体中的基因家族)...
如何从分子生物学水平讨论生物
进化
答:
例如人的细胞色素C与黑猩猩的差异为0,与猕猴的差异为1,与马的差异为12,与果蝇的差异为27,与向日葵的差异为38。可以根据各种生物的细胞色素C氨基酸一级结构的差异导出一个生物
进化树
,这个进化树要比传统的靠外观分析描述出的进化树更具科学性。随着各种生物的
DNA
序列逐步被破译,通过DNA序列进行生物...
为什么 四倍简并位点
构建系统树
答:
表型分枝图(phenogram)和进化分枝图(cladogram)两个术语已用于表示分别根据表型性的和遗传性的关系所
建立的
关系树。进化分枝图可以显示事件或类群间的进化时间,而表型分枝图则不需要时间概念。文献中,更多地是使用“系统
进化树
”一词来表示进化的途径,另外还有系统发育树、物种树(speciestree)、
基因树
...
微小生物的相关研究
答:
Brown等依据平行同源
基因构建的
“Cenancestor”生命
进化树
,认为生命的共同祖先Cenancestor是一个原生物。原生物在进化过程中产生两个分支,一个是原核生物(细菌和古菌),一个是原真核生物,在之后的进化过程中细菌和古菌首先向不同的方向进化,然后原真核生物经吞食一个古菌,并由古菌的DNA取代寄主的RNA基因组而产生真...
生物信息学研究的内容
答:
6、分子进化和比较
基因
组学,是最重要的课题之一 早期的工作主要是利用不同物种中同一种基因序列的异同来研究生物的进化,
构建进化树
。既可以用
DNA
序列也可以用其编码的氨基酸序列来做,甚至于可通过相关蛋白质的结构比对来研究分子进化。以上研究已经积累了大量的工作。近年来由于较多模式生物基因组测序任务...
信息工程在生物工程中的应用,具体点,300字左右…
答:
基因
组本身又是怎样
进化
的? 生物信息学的另一个挑战是从蛋白质的氨基酸序列预测蛋白质结构。这个难题已困扰理论生物学家达半个多世纪,如今找到问题答案要求正变得日益迫切。诺贝尔奖获得者W. Gilbert在1991年曾经指出:“传统生物学解决问题
的方式
是实验的。现在,基于全部基因都将知晓,并以电子可操作的方式驻留在数据...
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