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转录组测序报告
转录组测序
多久可以拿到
报告
答:
转录组测序
最快10个自然日可以拿到
报告
。转录组广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,快速转录组仅需12个自然日(12天=建库+测序+分析周期),而安诺可以7天完成转录测序,使快速转录组10个自然日完成。
空间
转录组
第四讲:最详细的10x空间转录组summary网页
报告
解读
答:
10x ***空间
转录组
网页版
报告
模板如下:下面来详细介绍一下每块区域每个指标的含义。Reads***总体情况统计区:Number of Reads***: 样本总的
测序
reads数,双端测序这个是指一端的reads数,实际上算数据量需要用reads 2 读长。Valid Barcodes***: barcode校准后有效的barcode数占总的reads的比例,S...
文献解读|单细胞联合空间
转录组测序
揭示脑神经炎性星形胶质细胞亚型...
答:
研究团队为了观察星形胶质细胞在炎症状态下的
转录组
如何随时间变化,对Aldh1l1eGFP
报告
小鼠进行了腹腔注射脂多糖(LPS)或生理盐水。纯化后的皮质星形胶质细胞进行了bulk RNA
测序
。结果发现,部分星形胶质细胞基因在3、24和72小时出现表达变化。2. 复杂的星形胶质细胞亚群分布于大脑不同区域 研究团队为了进一步...
文献解读| 单细胞联合空间
转录组测序
揭示脑神经炎性星形胶质细胞亚型...
答:
为了研究星形细胞炎症状态下
转录组
随时间的变化,本研究将 Aldh1l1eGFP
报告
小鼠腹腔注射脂多糖(LPS,诱导炎症)或生理盐水(对照)。LPS注射后3、24和72 h,对皮质星形胶质细胞进行荧光激活细胞分选(FACS)纯化,进行bulk RNA
测序
(图1a)。 结果发现大量星形胶质细胞基因在3、24、和72 h (图1 b, c) 出现表达变化,常...
转录组测序
5-基因差异表达分析
答:
转录组测序是最常用的组学实验,对全谱基因定量,找到差异表达基因。RNAseq涉及到原始数据,数据质控,基因组比对,差异基因鉴定,差异基因功能富集分析,重要基因如转录因子激酶的靶基因预测等,我们用10讲的时间,全面讲解
转录组测序报告
,及在上百个项目中遇到的近百个常见问题。 上一期视频 基因表达定量 中,我们讨论了在cl...
瞬息万变不过RNA——
转录组测序
常见问题集锦
答:
转录组测序
(即RNA-seq)是RNA研究很重要的手段,研究对象为特定样本在某一功能状态下所能转录出来的RNA情况。转录组研究是基因功能及结构研究的基础和出发点,通过新一代高通量测序,能够全面快速地获得某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本序列信息,已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物...
公司
转录组测序
结果可以直接用吗
答:
可以。测序公司都会提供结果
报告
的,可以根据图片和结果一一对应,或者直接找技术进行报告解读。正常情况下,放置3-5个月的
转录组测序
结果结果都可以有效检测。保存好一点,可放置数年仍能有效检测。
转录组
学分析流程
答:
转录组包括mRNA、非编码RNA(ncRNA)、核糖体RNA(rRNA)等。
转录组测序
关注特定细胞在特定状态下的RNA总和,包括mRNA和ncRNA。转录组具有时间、组织、空间特异性。若物种有高质量基因组序列且比对效率高,可采用有参分析;否则,采用无参策略进行转录本组装,构建unigene库,继续后续分析。转录组测序适用于...
转载---[
转录组
] 转录组专题——关于样本重复性问题小技巧
答:
转录组测序
通常要求设置3个生物学重复样本,如果样本足够多,建议比预期实验设计多送1~2个样本测序,以便后续某个样品与组内其它样本出现离群情况,直接剔除离群样本,省时省力。若测序样本较少,无法剔除样本,也可以考虑对同一批次的备份样本再次测序,后续再重新分析。 以上就是今天的关于样本关系分析问题,在此也向广大研...
转录组
学分析流程
答:
1. 数据来源 假设有两个不同组织(PR和SR),每个组织各区三个样本,一共六个样本,利用illumina平台进行
转录组测序
,得到双端测序数据。 数据原始格式为 .fq ,共有12条测序数据文件(每个样本产生两条)2. 测序数据质量评估 利用fastQC软件对获得的fastq序列文件进行质量分析,生成html格式的结果
报告
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