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生物学重复是6个样本嘛
宏基因组测序对
样品
的
生物学重复
有什么要求?如何避免重复性较差的问题出...
答:
土壤、水体等生态环境
样本
建议5个或5个以上的
生物学重复
;取样时每个
样品
均需多点取样后混匀,降低单个样本特异性。人和动物样本因个体特异性较大,建议10个以上生物学重复;肠道、瘤胃或粪便样本因含有较多厌氧菌,要快速取样、迅速低温保存,针对较难富集微生物的样品,如各种物体表面,可采用缓冲液洗脱或...
饲养鸡要几个
生物学重复
答:
6组,每组3个重复
。饲养鸡开产不要盲目追求鸡群体重,根据种培育至适宜的体重区间即可,以70克为分组梯度,分为6组,每组3个生物学重复,每个重复96只鸡,6组鸡群在同一栋舍、相同环境条件下饲养,持续观察20-63周龄的生产性能。蛋种鸡养殖者不要盲目追求鸡群体重,应根据品种特点,通过做好饲养管...
【一文读懂
生物学重复
与技术重复】
答:
生物学重复
(biological replicate):可以理解为我们对一个群体进行研究,但是我们不会对整个群体进行检测(考虑到成本和工作量的问题,我们肯定也不会采取这种地毯式的方法),只是抽取群体中的一部分进行检测,用
样本
来代表总体。这边样本个数,实际上就是生物学重复数。技术重复 (technical replicate):...
如何来设定转录组测序中的
生物学重复
答:
生物学重复
:指
样本重复
,比如3只小鼠,同时做一种处理,就是三个生物学重复。技术重复:一般是三次实验,比如对一块组织,提了三次RNA,做三次real time。2.设置生物学重复的意义 由于新一代测序技术的优越性以及高成本,曾一度忽略了“生物学重复”的重要性。但生物学重复对于测序实验的设计以及实...
转载---[转录组] 转录组专题——关于
样本重复
性问题小技巧
答:
② 对于细胞样品,生物学重复之间的差异性相对较小,建议3个以上生物学重复
; ③ 对于临床样品,由于供试者的基因型、生活方式、生活环境、年龄、性别可能存在较大差异,可能需要更多的生物学重复,一般10个生物学重复以上[4]。 Tips 在转录组测序时,一般不建议设置两个重复。因为如果两个重复样品结果不一致,无法确定以...
【转载】
生物学重复
与技术重复
答:
指对同一个处理组中独立来源的
重复样本
分别进行独立分析,是整个实验的完全重复,如将具有同一基因型的多个细胞株进行独立地测定。由于遗传和环境等因素的影响会引起有机体的个体差异,因此需要采用
生物重复
的实验设计方法来消除该差异。目前都以3次
生物学重复
实验设计为主,要求严格的实验可以做5次重复。
生物学重复是
什么?应该怎么设置?
答:
"生物学重复"指的是经过相同方式处理的相同
样品
。对照组A、B、C三只小鼠 (control A, B and C) 互
为生物学重复
。实验组A、B、C三只小鼠(Treated A)同样互为生物学重复。"生物学重复"的概念容易与"技术重复"相混淆。一般来说,技术重复指的是同一样品多次测量。如图所示,任一小鼠在板A、B、C...
由
生物学重复
引发出来的思考
答:
当
生物学重复
之间存在相关性,需要考虑有效
样本
数(effective sample size)effective genome size和effective sample size不一样,不要混为一谈 废话超多系列 首先我们区分一下生物学重复和技术重复,有的人可能不屑一顾,和我的反应一样。但是别着急,答应我先区分下面两种情况属于什么重复,答对了再嘲讽...
RNA-seq 中
生物重复
与测序深度的权衡
答:
生物重复是
指独立取样的个体数目。它对于估计生物过程中的变异性非常重要,有助于增强研究结果的统计力。更多的生物重复可以提高对实验条件下基因表达差异的检测能力,因为它们帮助区分生物变异和技术变异。测序深度是指对RNA
样本
进行测序的覆盖率,即平均每个转录本被测序读取的次数。测序深度影响基因表达水平的...
转录组数据绘制PCA图以及
生物学重复
的相关问题
答:
3)动物或者植物之间
样本
的差异还是比较大的,所以可以多测一点,例如可以做5-10个重复之类的。土豪的话你可以测任何你觉得吉利的数字,譬如66、88、996甚至2333等等。(玩笑话哈 )第三个问题:3只老鼠分别测序算重复,还是1只老鼠测3次算重复?回答:3只老鼠各测一次。搞清楚
生物学重复
和技术重复。
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