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生信服务集群
生信
分析平台搭建(十七):
服务
器配置
答:
二十二:
服务
器配置 1、CPU CPU是计算机的大脑,计算机的计算主要就是靠CPU来完成,所以,CPU非常重要,CPU的计算速度决定了计算机的计算能力。也就是水桶效应中最上面的那块木板。比如序列拼接这个工作,需要将测序的reads切成更小 的片段,然后将这些小片段根据序列间的关系,连成更长的片段,那么这些片段...
生信
分析入门 | 看完别说你不会生信了
答:
胃癌研究中,WGCNA技术帮助我们构建基因模块,通过模型预测患者的响应和治疗反应,这是
生信
分析在临床应用中的生动实践。R语言因其开源、强大的数据处理能力,成为了生信分析的首选工具,而Linux操作系统以其稳定性,尤其适合在
服务
器环境中运行和集成众多生信工具。随着研究的深入,热点领域如T细胞耗竭的机制分...
如何将参考基因组上传到
服务
器中
生信
答:
1、打开NCBI,点击Submit,然后会被导航到新的页面。2、选择提交的数据库。往下滑动的过程中,选择参考基因组进行数据提交,点击Submit即可。3、登录。在点击Submit之后,会继续导航到新的页面,并可能看到如下提示,这是在提示需要先登录NCBI然后再进行数据提交,目前NCBI支持微软账号直接登入。4、创建新的...
生信
电脑配置
答:
本人
生物信息
在读博士,平时主要做一些数据分析之类的。这个其实很取决于你分析的数据类型,如果你是做转录组的,建议最好是有40-60个线程的,内存有128Gb以上的
服务
器。GPU可以不需要,目前很多软件还不支持GPU加速。但如果你做的是基因组,那么这个服务器的配置可能很高,尤其是目前三代测序的普及,数...
生信
小型
服务
器推荐配置
答:
CPU AMD 5950x(16核32线程) 或者5900x (12核 24线程)内存 32gb*4 主板 普通的x570主板 硬盘:一片1tb的nvme 固态硬盘加若干块机械硬盘,前者用于分析数据,后者存储数据 配一个650瓦的电源 整个配置下来应该不到15000元 性能应该比一些四五万的intel
服务
器还好一点 如果是中小型的实验室,需要...
生信
分析中不可忽视的GTEx数据库
答:
为了揭示人体内组织间的遗传表达差异,GTEx项目收集了1641个尸检样本,涵盖175个个体的54个部位。2017年的Nature系列文章中,GTEx整合了449个个体的5500多个转录组数据,以及29个组织的940个单细胞转录组,同时结合了基因组序列,提供了详尽的转录基因表达数据查询
服务
。疑问二:何时呼唤GTEx的援助?在TCGA数据...
一起实验网
生信
靠谱不
答:
靠谱。根据查询企查查网显示,一起实验网,是云南一同实验教育科技有限公司旗下的生物实验技术
服务
网络平台,符合国家入网许可,拥有正规营业手续,是一家非常靠谱的平台机构。
一起实验网
生信
靠谱不
答:
靠谱。根据查询天眼查官网得知,一起实验网是云南一同实验教育科技有限公司旗下的生物实验技术
服务
网络平台。一同实验教育科技有限公司是一家从事生物医药研究、产品开发和生物技术服务的高科技公司,是经过国家工商局检查的合法合规的公司,所以靠谱。
生物信息
流程搭建方法
答:
CWL(Common Workflow Language)普通工作流语言和WDL(Workflow Description Language)工作流描述语言。定义每一个计算过程(脚本)的输入和输出,然后通过连接这些输入和输出,构成数据分析流程。可以在多个平台执行,比如本地
服务
器、SGE
集群
,云计算平台等,可以做到一次编写多处执行。Linux版本最有名的如...
哪些
生信
可以用个人电脑跑
答:
个人电脑通常可以运行一些基本的
生物信息
学软件和分析工具,但是对于更复杂和计算密集的生物信息学任务,可能需要更强大的计算资源,如
服务
器或云计算平台。以下是一些常见的生物信息学应用程序,可以在个人电脑上运行:1. 基本序列分析软件:包括NCBI BLAST、EMBOSS、CLC Sequence Viewer等。这些软件主要用于...
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