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如何通过蛋白质序列推测功能
已知一
蛋白
编码基因的
序列
,请问可采用
怎样
的方法分析,
推测
其
功能
答:
(一)用功能获得策略鉴定基因功能
,将目的基因直接导入某一细胞或个体中,使其获得新的或更高的水平表达,通过细胞或个体生物性状的变化来研究基因功能,常用的方法有转基因技术和基因敲入技术。(二)用功能失活策略鉴定基因功能,将细胞或个体的某一个基因功能部分或全部失活后,通过观察细胞生物学行为...
如何
推定一条新鉴定的
蛋白质序列
的生物学
功能
?
答:
1,
通过blast寻找其同源蛋白,如果有,再根据其同源蛋白的功能推测其功能,并实验检测
。2,如果没同源蛋白,那就麻烦了。建议先通过融合GFP确定该蛋白的亚细胞地位,上调、下调该蛋白,观察一些指标。
基因组信息学的
蛋白质功能
预测
答:
这些问题通常需要借助合适的数据库搜索软件才能解决
。通过合适的序列相似性搜索算法可对未知蛋白质进行家族归类。最常用的是BLAST算法,它主要基于相似片段的比较。通常一系列相似的序列可归为一个家族,并具有该家族特有的三维结构。在此基础上建立的三维结构和序列相结合的比较算法就具有更强的搜索能力。更...
如何
测未知
蛋白质功能
答:
现在最常用的方法就是knockout
就是把这个基因从基因组中剔除 一般做基因敲除的小鼠 看这个小鼠和正常的小鼠有什么不同 然后推测这个蛋白的功能 这种方法得到了07的诺贝尔奖 不过这个方法也有局限 如果这个基因在生长发育过程中非常重要 那么基因敲除的小鼠根本不能出生 这个技术发展出了条件敲除 在特定的...
如何
从氨基酸顺序预测
蛋白质功能
?
答:
首先,需要指出的是,在下默认为题主说的是氨基酸测序后
通过
预测高级结构分析
蛋白质功能
。因为,作为一个搞蛋白质功能研究的人,我可以很肯定地说,能通过一级
序列
预测蛋白质功能的人或者机器或者软件或者方法还没有问世。那么,实验室一般怎么做呢?得到序列做实验之前,我们会选择通过在线服务预测一下二级...
目前,目前关于
蛋白质
的空间结构的预测有哪些方法和手段,效果
如何
?
答:
1、
通过
实验的方法预测
蛋白质
结构,即对蛋白质晶体使用X射线衍射或核磁共振,得到晶体电子密度等方面的信息,从而分析蛋白质结构。这是结构生物学的方法。该方法结果准确可信,但是工作量大,难度也比较高。例如要结晶得到纯度高的蛋白质晶体有时候是很困难的,各种条件要慢慢摸索,往往要靠运气。2、用...
一直氨基酸
序列
,
如何
查看其
蛋白质
基本性质,及其结构
答:
。三、如果建得了模型,swiss-model会给出建模所参考的模版的编号,你可以用这个编号在pdb数据库中搜索相应的
蛋白质
结构。四、如果该蛋白的活性中心已经被人们研究得知的话,那么比对你的
序列
和模版序列相似的区段的话,你就可以大致判断你的这段序列是否可能存在潜在的
功能
...
从
蛋白质
的氨基酸
序列
可预测其生物学
功能
这句话对吗?
答:
不对。
蛋白质
的
功能
取决于蛋白质的空间结构。也就是说即便是氨基酸
序列
相同,空间结构不同,生物学功能也不同。
如何
阐明某个
蛋白
的基因结构与
功能
?简述其研究方法与步骤。
答:
【答案】:阐述某个
蛋白质
的基因结构:(1)用微量顺序仪测定该蛋白质的N-端30个氨基酸的
序列
;(2)按照遗传密码预测相应于氨基酸序列的mRNA核苷酸序列;(3)用快速固相化学合成法合成一系列短的DNA片段,15~20核苷酸长,它们能和mRNA的部分序列形成互补碱基对;(4)将这些短的DNA片段和细胞总的mRNA杂交,...
急求解答:
蛋白质
二级结构的预测的方法?
答:
片段体现了中心残基所处的环境。③第三代方法(考虑多条序列)运用长程信息和
蛋白质序列
的进化信息,准确度有了比较大的提高。 蛋白质二级结构预测方法:首先预测蛋白质的结构类型,然后再预测二级结构。 ①经验参数法:是一种基于单个氨基酸残基统计的经验预测方法。
通过
统计分析,获得的每个残基出现...
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